層流手術室凈化驗收需要遵循相關標準和流程，以保證工程驗收合格，保證正常使用。手術室凈化空調系統的調試工作是工程驗收階段不可少的一項重要工作。通過調試可以及時發現施工中存在的一些缺陷并及時進行整改和修補，調試對設計圖紙也是一個重要的驗證(Experimental)過程。
層流手術室凈化中潔凈室和空調送回風管道應在安裝高效過濾器(作用:過濾雜質等)前達到清潔要求，凈化空調系統必須連續（Continuity)空吹12小時以上，空吹后再對送回風管和空調機組內部進行清掃和擦洗干凈。層流手術室凈化采用高效低毒消毒劑，以及合理使用，是保障一般手術室無菌環境的有力措施。根據不斷討論與反復斟酌，修訂后《綜合醫院建筑設計規范》中，關于一般手術室的條文最終確定為：“一般手術室應采用末端過濾器不低于高中效過濾器的空調系統或全新風通風系統。潔凈手術室裝修手術室（operating room 英文簡稱o.r）是為病人提供手術及搶救的場所，是醫院的重要技術部門。手術室應與手術科室相接連，還要與血庫、監護室、麻醉復蘇室等臨近。
層流手術室凈化竣工后建設單位應組織醫療部門、使用潔凈室的相應科室、設計和施工單位依照工程設計文件和《醫院潔凈手術部建筑技術標準》 (GB50233-2002)、《通風與空調工程施工驗收標準》(GB50243-2002)和《潔凈室施工及驗收標準》(JGJ71-90)等有關施工 質量驗收標準對潔凈室進行嚴格的質量驗收，并應委托有資質的第三方檢測單位對潔凈室內潔凈度對照設計文件和有關標準規范進行檢測。
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