1、手術室內的墻面和天花板要采用堅實、隔音、光滑、清潔的材料，在顏色方面最好選擇淡色，墻角要設計為圓形，防止積灰。凈化手術室采用空氣潔凈技術對微生物污染采取程度不同的控制，達到控制空間環境中空氣潔凈度適于各類手術之要求；并提供適宜的溫、濕度，創造一個潔凈舒適的手術空間環境。
2、手術室門要寬大便于進出，還要避免使用易擺動的彈簧(Spring)門，以防氣流使塵土及特殊結構:莢膜、鞭毛、菌（fungus)毛飛揚。手術室裝修確保手術臺潔凈度達標，一般多采用垂直層流式效果較好 層流手術室是一個"正壓"環境，其空氣壓力根據其不同區域（如手術間、無菌準備間、刷手間、麻醉間和周圍干凈區域等）潔凈度不同要求而不同。窗戶最好是雙層而且是用鋁（Al)合金(熔點660℃)窗框，有利防塵保溫。
3、對于地面設計應采用堅固、光滑易清洗的材料，還要將地面稍傾斜以利于排水，避免產生污染。
4、手術室出入路線要設計合理。凈化手術室采用空氣潔凈技術對微生物污染采取程度不同的控制，達到控制空間環境中空氣潔凈度適于各類手術之要求；并提供適宜的溫、濕度，創造一個潔凈舒適的手術空間環境。最好是設計三條出入路線，一為工作人員出入路線，二為傷病人出入路線，三為器械敷料等循環（continue)供應路線，盡量做到隔離，避免交叉感染。
5、手術室門是腳動的，設有自動延時關閉裝置的電動懸掛式自動推拉門，這樣便不會產生手污染了。潔凈手術室門凈寬不宜小于1.4m，方便醫生和手術床進出。
